...чи в українській мові в принципі колись вживалося слово ДЕРЕВНЯ саме для означення поселення -- якщо дійсно такого не бувало, то питання переводиться в іншу площину: як називають у нас таке село, що в Росії зветься "деревня"?
Якщо мається на увазі маленьке село без церкви, то пошук в Інтернеті "село без церкви" (саме отак в лапках, щоб шукалася комбінація) наводить на роздуми -- а чи бувають (точніше, чи були до 1917) в Україні села без церкви? Окремі віддалені господарства без церкви звуться інакше -- хуторами.
Якщо розглядати версію про будівельний матеріал, то в степу хати з дерева -- розкіш, а в Карпатах, хоч і лісу повно, та все одно поселення звуться селами (Ви десь чули про карпатські дєрєвні? Я таке бачив тільки в російськомовних текстах).